Plik:Minimum Evolution-Tree Aleurobotrys and related Taxa.svg

Ôryginalny zbiōr(Zbiōr SVG, nōminalnie 364 × 476 pikselōw, srogość zbioru: 20 KB)

Tyn zbiōr je ze Wikimedia Commons i może być używany we inkszych projektach. Ôpis na jego zajcie ôpisu zbioru je pokŏzany pod.

Ôpis

Figure. Figure. Evolutionary relationships of Aleurobotrys and related Taxa
The evolutionary history was inferred using the Minimum Evolution method [1]. The optimal tree with the sum of branch length = 0.24349473 is shown. The percentage of replicate trees in which the associated taxa clustered together in the bootstrap test (1000 replicates) are shown next to the branches [2]. The tree is drawn to scale, with branch lengths in the same units as those of the evolutionary distances used to infer the phylogenetic tree.(For all > 50%) The evolutionary distances were computed using the Kimura 2-parameter method [3] and are in the units of the number of base substitutions per site. The ME tree was searched using the Close-Neighbor-Interchange (CNI) algorithm [4] at a search level of 2. The Neighbor-joining algorithm [5] was used to generate the initial tree. The analysis involved 20 nucleotide sequences. All positions with less than 95% site coverage were eliminated. That is, fewer than 5% alignment gaps, missing data, and ambiguous bases were allowed at any position. There were a total of 1171 positions in the final dataset. Evolutionary analyses were conducted in MEGA6 [6].


1. Rzhetsky A. and Nei M. (1992). A simple method for estimating and testing minimum evolution trees. Molecular Biology and Evolution 9:945-967.
2. Felsenstein J. (1985). Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39:783-791.
3. Kimura M. (1980). A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. Journal of Molecular Evolution 16:111-120.
4. Nei M. and Kumar S. (2000). Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York. 5. Saitou N. and Nei M. (1987). The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution 4:406-425.
6. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., and Kumar S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution30: 2725-2729.

List with GenBank Sequences
Data
Zdrzōdło Włŏsnŏ robota
Autōr Thkgk
Przizwolynie
(Użycie tego zbioru)
Ja, właściciel praw autorskich do tego dzieła, udostępniam je na poniższej licencji
Creative Commons CC-Zero Ten plik udostępniony jest na licencji Creative Commons CC0 1.0 Uniwersalna Licencja Domeny Publicznej.
Osoby, które współpracowały przy tworzeniu tego utworu przeniosły go do domeny publicznej poprzez zrezygnowanie ze wszystkich przysługujących im praw na obszarze całego świata z tytułu prawa autorskiego oraz wszystkich powiązanych i podobnych praw, w zakresie dopuszczalnym przez prawo. Możesz kopiować, zmieniać, rozprowadzać i wykonywać to dzieło, nawet wykorzystując do celów komercyjnych bez pytania o pozwolenie.

Podpisy

Wyekleruj we jednyj linijce, co tyn zbiōr pokazuje

Obiekty przedstawione na tym zdjęciu

przedstawia polski

licencja polski

CC0 polski

Gyszichta zbioru

Kliknij w datã/czas, żeby ôbejzdrzeć zbiōr, jak wtynczŏs wyglōndoł.

Data i czasMiniaturaWymiaryUżywŏczKōmyntŏrz
terŏźnŏ21:39, 2 wrz 2014Miniatura wersyje 21:39, 2 wrz 2014364 × 476 (20 KB)Thkgk{{Information |Description=Figure. Figure. '''Evolutionary relationships of Aleurobotrys and related Taxa'''<br/> The evolutionary history was inferred using the Minimum Evolution method [1]. The optimal tree with the sum of branch length = 0.24349473...

Ta strōna używŏ tego zbioru:

Globalne użycie zbioru

Tyn zbiōr je używany tyż we inkszych projektach wiki:

Metadane